> PROGRAMME N°1 : Santé Mère Enfant

Objectif Général   
Contribuer à atteindre les objectifs du millénaire pour le développement de la Côte d’Ivoire de 2006 à 2015 par la réduction de trois quarts, des taux de mortalité maternelle et de mortalité néonatale, de deux tiers, du taux de mortalité infantile et de moitié, la prévalence du VIH/SIDA chez les femmes enceintes.

Axes de recherche prioritaires

- Santé de la femme et de la mère
- Santé de l’enfant  
- Santé des jeunes 
Protocole 1 :
Prise en charge intégrée de la mère séropositive et de son enfant dans une approche communautaire à l’INSP.

> PROGRAMME N°2 : Nutrition et maladies métaboliques

Objectif Général   
- Déterminer l’état nutritionnel des femmes et des enfants en vue d’une prise en charge efficiente, notamment des malnutris.
- Déterminer l’impact des aliments glucidiques locaux dans les troubles métaboliques.

Axes de recherche prioritaires
 - Malnutrition protéino–énergétique
 - Troubles de la carence en micronutritments (vitamine A, iode, fer, etc…)
 - Amélioration du diagnostic et de la prise en charge dudiabète en Côte d’Ivoire
Protocole 2 :
Index glycémique des aliments locaux couramment consommés en Côte d’Ivoire.

> PROGRAMME N°3 : Maladies mentales et environnement psychosocial

Objectif Général
Intégrer la composante santé mentale dans les actions d’aide aux populations en post-conflit.

Axes de recherche prioritaires
- Formulation de politiques et élaboration de programmes (avec intégration de la santé mentale dans les services de santé généraux et au niveau communautaire)
- Évaluation des états de Stress Post Traumatiques [situation d’urgences et de catastrophes (conflits)]
- Santé mentale des enfants et des adolescents
Protocole 3  :
Prise en compte de la composante santé mentale dans la reconstruction nationale post-conflit en Côte d’Ivoire.

> PROGRAMME N°4 : Infections sexuellement transmissibles VIH/ SIDA

Objectif Général 
Contribuer à l’amélioration de la prise en charge des IST et du VIH/SIDA

Axes de recherche prioritaires

 - Aspects techniques de la prise en charge des IST
 - Aspects épidémiologiques
 - Aspects promotionnels
Protocole 4  :
Prise en charge intégré du VIH/ SIDA dans les communautés

> PROGRAMME N°5 : Maladies à transmission vectorielle

Objectif général 

Initier et exécuter des travaux de recherche pluridisciplinaires focalisés :
- sur les répercussions des types de contacts homme/vecteur liés aux comportements humains et aux changements climatiques
- sur les enjeux socio économiques des maladies endémiques à transmission vectorielle.

Axes de recherche prioritaires
 - Paludisme
 - Trypanosomiase Humaine Africaine
 - Arboviroses (fièvre jaune, dengue, chickungunya)
 - Ulcère de Buruli
Protocole 5  :
Aspects épidémiologiques du paludisme en zones côtières et lagunaires de Côte d’Ivoire
Protocole 6 :
Suivi des séropositifs au CATT et négatifs à la parasitologie dans le foyer de la trypanosomiase africaine (THA) de Bonon (Côte d’Ivoire).
Protocole 7 :
Evaluation entomologique et virologique du risque d’émergence du virus chikungunya dans la ville d’Abidjan et ses alentours.
Protocole 8 :
Etude des réservoirs/ vecteurs potentiels de Mycobacterium ulcerans dans l’environnement de Côte d’Ivoire.

> PROGRAMME N°6 : Santé Environnementale

Objectif général

Connaître l’impact et l’interaction des facteurs environnementaux sur la santé.

Axes de recherche prioritaires

- Étudier les substances toxiques présentes dans nos divers environnements
- Analyser, modéliser les cinétiques, les dynamiques spatiales et temporelles des communautés d’agents infectieux et parasitaires de plusieurs groupes d'hôtes
- Étudier l’organisation et  le fonctionnement des populations Hôtes/Pathogènes. 
Protocole 9 :
Evaluation des risques sanitaires liés à l’utilisation des pesticides en Côte d’Ivoire : approche par l’identification et utilisation de biomarqueurs.

> PROGRAMME N°7 : Médecine traditionnelle

Objectif général

Évaluer l’efficacité, l’innocuité et la biotolérance des recettes traditionnelles à base d’extraits de plantes en Côte d’Ivoire 

Axes prioritaires de recherche

- Repérer les actes et traitements médicaux traditionnels 
- Vérifier l’efficacité des recettes médicales traditionnelles 
-Tester l’innocuité et la biotolérance des tradimédicaments
Protocole 10 :
Evaluation de l’efficacité des recettes traditionnelles utilisées dans le traitement du VIH/SIDA et du paludisme dans la région d’Abidjan.    

> PROGRAMME N°8 : Politiques et Système de santé

Objectif général

Analyser  la situation actuelle  du système de santé ivoirien après le déclenchement de la guerre.

Axes prioritaires de recherche

- Identification des forces et insuffisances du système de santé existant
- Analyse des indicateurs de santé après le déclenchement de la guerre
- Définition des objectifs précis, évaluables, spécifiques aux problèmes de santé de chaque région de la Côte d’Ivoire.
Protocole 11 :
Contribution d’un district de démonstration à la relance du système sanitaire de côte d’Ivoire
Protocole 12 :
Prise en compte de la composante et évaluation du revenu des personnels de santé en Côte d’Ivoire
Protocole 13 :
Contribution à la mise en place d’une démarche d’accréditation des districts de santé dans le cadre de la politique sanitaire en Cote d’Ivoire
Protocole 14 : Contribution à l’amélioration de la prise en charge de l’anémie sévère de l’enfant de moins de cinq ans dans les hopitaux de reférence de districts sanitaires.